Formé au FC Nantes, il effectue ses débuts professionnels en 1996 contre le SC Bastia à l'âge de 17 ans. Depuis lors, il n'a cessé de prendre de l'ampleur en devenant le capitaine des Canaris dès l'âge de 19 ans et un élément essentiel de l'équipe, étant souvent décisif même. C'est l'un des meilleurs gardiens de sa génération et compte 3 sélections en équipe de France.

Mickaël Landreau est réputé pour avoir stoppé de nombreux penalties durant sa carrière et notamment lors de son premier match en D1 à Bastia en 1996 où il stoppa la tentative de Moravcik. Depuis, celui que les fans surnomment Micka a montré qu'il aimait le spectacle et... sa Panenka en est la preuve. Tenter ce geste lors de la finale de coupe de la ligue 2004 put paraître déplacé mais Mickaël est comme ça, ce qui eut néanmoins pour effet de faire perdre la coupe de la Ligue au FC Nantes. Néanmoins, nul ne peut oublier aussi ce seizième de finale de coupe de la Ligue 2002-2003 où Mickaël a stoppé le penalty de Ronaldinho en ne se plaçant pas au centre de son but alors que le score était seulement de 3-2 pour le FC Nantes.

Mickaël Landreau aime son club et les supporters le lui rendent bien comme en témoigne la banderole « Respect à notre capitaine » déployée lors du derby Nantes-Rennes le 15 janvier 2005, cette banderole faisant suite à la rébellion de Mickaël Landreau contre son président Jean-Luc Gripond qu'il avait ouvertement critiqué dans France football avant d'être convoqué dans le bureau de ce dernier. Mais, à la surprise de Jean-Luc Gripond, Mickaël Landreau n'arriva pas seul. En effet, il était accompagné de tout le groupe professionnel qui a fait preuve ce jour là d'une grande solidarité envers son capitaine.

Le 30 juillet 2005, a l'occasion du match de Ligue 1 Nantes - Lens, il fête son 300e match de championnat à seulement 26 ans. Au terme de sa période nantaise, il a joué 335 matches de championnat en Ligue 1 et 30 matches de coupes d'Europe.

Mika annonce son départ du club sans préciser sa destination juste avant la fin de la saison 2005-2006. Le 6 mai 2006, au cours de son dernier match au Stade de la Beaujoire, il reçut un vibrant hommage de la part de ses supporters qui saluèrent celui qui pendant treize ans aura porté le maillot nantais.

Landreau au PSG

Le transfert au PSG est signé le 15 mai 2006. Mickaël s'engage pour quatre saisons avec pour objectif de "réussir à Paris". Pour son premier match officiel avec le PSG (Trophée des Champions 2006), habituellement spécialiste des arrêts de pénaltys, il en encaisse un pendant le match et n'en arrête aucun sur cinq lors de la séance de tirs aux buts.